Journée ImabioTED du 20 juin 2018

Enthousiasmer, motiver et ouvrir l’esprit aux innovations en Biophotonique

Le GDR ImaBio a organisé le mercredi 20 juin 2018, à Marseille (IBDM), une journée de présentations des dernières innovations de ses partenaires industriels.

Cette journée, ImabioTED, s’est déroulée de 10h30 à 16h à l’institut de Biologie du Développement de  Marseille Luminy. Chaque industriel avait la possibilité de présenter deux innovations technologiques. Vous pouvez retrouver ces présentations sur les liens ci-dessous :

Partie 1

Partie 2

 

Voici aussi les résumés fournis par nos partenaires :

 

Imager le vivant en haute définition et en haut débit.
Depuis plus de 100 ans, Nikon propose des solutions d’imagerie permettant aux scientifiques d’étudier avec précision des évènements biologiques se déroulant à l’échelle microscopique. Deux nouveautés Nikon ouvrent de nouvelles perspectives d’explorations aux biologistes : le système de microscopie robotisé haut débit LIPSI et le système de microscopie confocale A1R+ HD 1K. Ces deux solutions peuvent être combinées pour imager en haute résolution, de manière très rapide, de larges champs d’observation grâce à des processus d’acquisition et d’analyse automatisés via une interface graphique intuitive et unifiée.

Bring high resolution, high content imaging to life.
Since 1917, Nikon provides imaging solutions to study biological events at the microscopic scale. New prospects for scientists to explore the biological models deeper, sharper and faster are now possible with the new high definition ultrafast confocal system A1R+ HD 1K and the new high content robotic microscope LIPSI. Both can be combined into a single platform to allow high speed, high resolution, large FOV imaging with an automated workflow via a single intuitive GUI.
La famille des systèmes Olympus IXplore ouvre de nouvelles voies pour la recherche en sciences de la vie. Elle offre aux chercheurs une expérience facilitée de l'utilisation de microscope grâce à son haut niveau d'automatisation des modes d'acquisition dans toutes les dimensions du vivant. IXplore Pro offre tous les outils pour l'automatisation des tâches d'acquisition multicouleur XYZ. IXplore Live est la nouvelle solution pour l'observation des modèles biologiqiues vivants au cours du temps.
IXplore Spin est le système spinning disk confocal rapide d'Olympus. Ie est complétée par IXplore Spin SR10 la modalité de superrésolution live permettant l'acquisition d'images à haute vitesse, basse phototoxicité à une résolution de 120nm. La gamme IXplore peut aussi se dote rde fonctionnalités additionelles tels que l'illumination TIRF et un module de photomanipulation à haute précision. Le tout est exploité grâce aux nombreuses optiques comprenant les objectifs à immersion silicone pour l'imagerie du vivant.
L4Cc and L6Cc series – Flexible by design
The third generation of Oxxius wavelength combiner offer in standard up to 6 combined wavelengths. The L4Cc/L6Cc can be internally configured in order to provide one or two independent channels for FRAP or when UV or NIR lines are needed.
Its innovative design provides the unrivalled level of flexibility by receiving extension modules which will offer advanced features and functionalities, like multiport, fast port optical switch, adjustable neutral density filter, AOTF, one additional laser… The extension modules can be added or permuted later on to preserve the initial investment.
PHASICS propose deux nouvelles innovations dans le domaine de l’imagerie de phase quantitative. Le SID4 Haute Définition utilise un nouveau concept d’analyse de surface d’onde qui permet d’obtenir des images de phase quantitative jusqu’à 5.5Mpixels. PHASICS propose également des solutions d’imagerie thermique microscopique pour le contrôle du chauffage localisé des cellules et la détection des nanoparticules d’or.
Lifetime imaging in an instant SP8 FALCON
The new Leica SP8 FALCON (FAst Lifetime CONtrast) is the future of functional imaging.
SP8 FALCON is the first truly integrated solution for Fluorescence Lifetime Imaging (FLIM) and delivers results at least 10x faster than conventional systems. SP8 FALCON adds a new dimension of contrast to your imaging, opening the door to biosensing, tracking of interactions between proteins, and apply lifetime contrast to separate multiple fluorophores.
Maximum information from each specimen with LIGHTNING
LIGHTNING detection package maximizes the information you extract from your specimen. The key for LIGHTNING is an adaptive process for extraction of information in the image. Unlike traditional technologies, that use a global set of parameters for the full image, LIGHTNING calculates an appropriate set of parameters for each voxel to uncover every detail with the highest fidelity to reach down to nanoscale resolution (120 nm).

Imagerie en temps de vie instantanée avec SP8 FALCON
Le nouveau SP8 FALCON (pour FAst Lifetime CONtrast) est le futur de l’imagerie fonctionnelle. FALCON est la première solution FLIM entièrement intégrée, et présente des performances au moins 10x plus rapides que les techniques conventionnelles. Ajoutez une nouvelle dimension à votre dispositif d’imagerie, ouvrez la porte aux biosenseurs, au suivi des interactions protéiques, et augmentez le contraste grâce au temps de vie pour la séparation spectrale.

Un maximum d’information de tous vos échantillons avec LIGHTNING
Le package de détection LIGHTNING vous permet de tirer le maximum d’information de vos échantillons. Le principe de LIGHTNING réside dans un processus adaptatif d’extraction de l’information contenue dans l’image. Contrairement aux techniques traditionnelle qui utilisent des paramètres globaux, LIGHTNING adapte les paramètres à chaque voxel pour révéler tous les détails avec une résolution jusqu’à 120nm.
BioAxial développe et commercialise des modules d’imagerie de super résolution (ou nanoscopie) pour les Sciences de la Vie et plus particulièrement pour la microscopie de fluorescence intracellulaire. Sa technologie totalement innovante, en rupture par rapport aux technologies existantes, permet d’accéder à la super résolution sur des échantillons fixés ou vivants avec une très faible phototoxicité, pour un coût raisonnable. Les axes de R&D sont la biologie, l’optique, les logiciels et les algorithmes de reconstruction et de traitement d’images. Cette année capitale consacre le lancement de uCODIM, 2nde génération d’instruments, adaptable sur n’importe quel microscope plein champ, et le renforcement du portefeuille de brevets avec notamment le « Dark Tracking », qui permettra d’atteindre des niveaux de résolution jamais égalés jusqu’ici.
Ultima Neuralight 3D : 3D Optical Stimulation and Multiphoton Imaging in behaving animals
InVi-SPIM : Long-Term 3D Fluorescence Imaging of Living Specimens
Tomocube HT2-S : Système d’Holotomographie Corrélative
Le système Tomocube est un microscope dédié à l’observation non invasive de cellules vivantes. Ce système utilisant l’analyse de phase quantitative permet de visualiser les cellules et de discriminer ses composants sans marquage, en 2D et 3D, avec un pouvoir résolutif (en XY et Z) 2 fois supérieur à celui d’un microscope confocal. Les données quantitatives des tomogrammes 3D permettent d’observer aisément l’évolution des paramètres morphologiques, chimiques et mécaniques au cours du temps. Ce système permet également de corréler les données de fluorescence en 2D ou 3D avec la distribution des indices de réfractions qui constituent les tomogrammes.
Bringing high throughput into a super resolution microscopy by pattern recognition approaches.

Bispecific antibodies has demonstrated its efficacy in clinical trial, especially in acute myeloid leukemia. The selection of the more potent bi-specific monoclonal antibody (Bs Mab) based on immune synapse and (Bs Mab) T cell killing effect need to be statistically validated. To achieve this goal, we decided to automatize conical diffraction microscopy imaging (CODIM) by introducing a pattern recognition module. Based on the immune cell-tumoral cell contact and perforin release features, the system is able to screen samples on 96 well plate or glass slide. It recognizes the specific pattern previously in confocal mode before switching to CODIM and generating batch of 2D or 3D images were T cell, tumoral cell and perforin is visualized.
L'Albédo est un dispositif qui transforme un faisceau laser gaussien en un faisceau de profil d'intensité "top-hat", homogène à 97% et de forme carré.
De part sa technologie, il obtient:
- un rendement de puissance élevé, de 90%,
- un domaine spectral étendu: 350 nm-800 nm
- il supporte de fortes puissances, jusqu'à 50W.

Applications:
-Photo manipulation
-Eclairage en microscopie
La toute dernière génération de lasers Chameleon Discovery sera présentée, en expliquant les motivations qui ont conduit à son développement, à partir de la compréhension par la société des besoins exprimés par les utilisateurs. Les solutions proposées par Coherent pour répondre aux nouveaux besoins de l’imagerie en neurosciences tels que l’opto-génétique et l’imagerie 3 photons en profondeur seront aussi présentées.
Abbelight offers a unique and complete expertise in Single Molecule Localisation Microscopy (SMLM). Created by scientists for scientists, we provide not only original and cutting-edge instruments but also a comprehensive range of services from sample preparation to training, reagents (SmartKit buffer) and data analysis. Our SAFe system is the first 3D isotropic nanoscope with real 20 nm precision over few microns depth for upgrading any inverted microscope. Our goal is to help our clients mastering super-resolution, and getting fast, reliable and reproducible nanoscopy images
Carl Zeiss est un acteur majeur des technologies de microscopie électronique et de microscopie optique. Le développement d’approches innovantes permettant de rapprocher ces deux mondes est au cœur de notre innovation. Nous œuvrons à réduire les différences de résolutions entre ces deux types de microscopie, de rendre accessibles la microscopie électronique au plus grand nombre, de généraliser les approches statistiques et/ou d’avoir des approches multimodales.
L’Optique Adaptative (OA) permet de corriger les aberrations et d’obtenir des images de bien meilleure qualité. Cette technologie est de plus en plus largement utilisé en microscopie. Elle démontre quotidiennement sa puissance et sa maturité dans beaucoup d’applications.
ALPAO, leader mondial dans domaine des miroirs déformables et de l’optique adaptative, présentera les dernières avancées de ses clients dans ce domaine. Les nouvelles solutions « plug and play » seront également présentées.
UltraMicroscope: Whole organ down to single cells.
Understanding basic principles in biology and medicine requires comprehensive studies. However, imaging brain or any other organ as a whole has not been possible by now. Sectioning is still the preferred approach when it comes to imaging, which most probably destroys connections, causes loss of tissue and therefor loss of information. LaVision BioTec’s UltraMicroscope in combination with tissue clearing methods lights up the entire puzzle. For the first time the whole picture is visible including all organ down to single cells.
L'IncuCyte S3 est un système de microscopie automatisée permettant de réaliser du screening phéntotypique quantitatif de cellules vivantes sur plusieurs jours directement au sein de l'enceinte d'un incubateur de cellules à CO2 standard. L'IncuCyte permet le suivi cinétique des cellules en contraste de phase et en fluorescence, avec une analyse des images complètement automatisée.
L'IncuCyte permet de réaliser différentes applications type prolifération cellulaire, cytotoxicité, apoptose, suivi de cultures ou de Sphéroides 3D, motilité/migration/invasion cellulaire, Immune Cell Killing, phagocytose, suivi de gène rapporteur… les champs d'applications sont la recherche en oncologie, Immunologie, Immuno-Oncologie, Neuroscience, Métabolisme etc.
Présentation d’une nouvelle génération de microscope à feuillet de lumière permettant l’optimisation de la résolution spatiale et temporelle. Le Microscope Alpha3 est doté d’un illuminateur à feuille de lumière multidirectionnelle et d’une unité de détection intégrant une lentille accordable. L’architecture optique du microscope permet a) un balayage temps réel du focus laser afin de maintenir l’épaisseur de feuille minimal en tout point du champ observé b) l’acquisition de stacks d’images à la fréquence de la caméra sans déplacement de l’’échantillon.
Invented in 1986, Atomic Force Microscopy (AFM) is now reaching its technical potential for biological imaging on the cellular and molecular level.
These technical progresses of AFM are paralleled with the emergence of mechanobiology as a field of high relevance for biological and medical research, justifying the need for imaging and mechanical characterization at a relevant resolution for biology. Thanks to recent developments by JPK Instruments, it is now possible to obtain AFM-based, quantitative mechanical data on biological specimen with nanometer resolution, thanks to JPK QI-mode. Additionally, the JPK NanoWizard ULTRA Speed enables robust, nanometer-resolution bioimaging with limited invasiveness, and acquisition rates below the second, without sample labelling and in physiological conditions.
Positionnement de précision pour la microscopie :

Le groupe PI développe des systèmes haute résolution basés sur des technologies d’actionnement piézo-électriques pour la microscopie.

Les systèmes proposés sont destinés à positionner rapidement et avec précision les objectifs de microscopes, les échantillons ou bien à déplacer une surplatine.

Les systèmes PI équipent les microscopes commerciaux mais également les systèmes spécifiques développés par nos clients.
Advances in the research fields of biological, biophysical and biochemistry rely on the development of novel, flexible, powerful and reliable laser sources in the visible – NIR part of the spectrum. Optical excitation in the 750-800 nm region, with flexible pulsed formats, can be advantageous in applications such as confocal fluorescence microscopy, STED, FLIM microscopy, photoluminescence spectroscopy, laser photocoagulation and time-resolved spectroscopy. Electronically ultra-short pulse formation can indeed provide significant enhancement in many of those techniques optimising temporal parameters (pulse duration, delay, etc.) of the optical excitation with respect to the specific characteristics of the fluorophore of interest such as its excited-state lifetime for example.
We will present a new ultrafast pulse generation based on pulse sampling from continuous wave laser signal. It allows the independent and fine tuning of many pulse parameters on a wide range such as the pulse duration, the repetition rate, the peak power and the pulse energy.

 

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