Programme de Mifobio 2018

Le programme complet des activités proposées au cours de l’école (cours, séminaires, ateliers, tables rondes, …) est disponible sur le document (5,3 Mo) téléchargeable sur ce lien : Book mifobio web

Un exemplaire papier sera distribué aux participants à Mifobio à leur arrivée sur site, donc évitez les impressions inutiles !

 

L’organisation des cours/ateliers/séminaires/tables rondes est donné par le tableau suivant :

 

Liste des modules (lectures list)

Module 1 – Imagerie multicellulaire : embryon, organoïdes et tissus

David HORL, LMU, Munich, Allemagne – BigStitcher: reconstructing high-resolution image datasets of cleared and expanded samples.

Liangyi CHEN, Peking University, Chine – High resolution miniature two-photon microscopy.

Guillaume DUGUE, ENS, Paris, France – Principles and applications of optogenetics in neurosciences.

Nicolas RENIER, ICM, Paris, France – A framework for the study of molecular patterns, axonal projections and neuronal activity in intact adult brains using light sheet microscopy.

Gaëlle RECHER, LP2N, Bordeaux, France – Driving cell self-assembly for the generation of shape-controlled organoids.

Andrea BASSI, Politecnico di Milano, Milan, Italie – Systemic imaging with light sheet fluorescence microscopy

 

Module 2 – Nanoscopies : de la molécule à la cellule, marquage, quantification

Ralf JUNGMANN, Martinsried, Allemagne – Titre à venir

Bassam HAJJ, Institut Curie, Paris, France – Accessing the third dimension in single molecule localization microscopy: challenges and implementations.

Ricardo HENRIQUES, University College, London, Grande-Bretagne – Democratising high-quality super-resolution microscopy enabled by open-source analytics in ImageJ.

Ilaria TESTA, SciLifeLab, KTH Royal Institute of Technology, Suède – MoNaLISA optical nanoscopy for gentle and rapid live cell imaging.

Valentin NAGERL, IINS, Bordeaux, France – Super-resolution microscopy for neuroscience: new methods & applications.

Christophe ZIMMER, Institut Pasteur, Paris, France – Titre à venir.

 

Module 3 – Mécano-biologie

Jean-Léon MAITRE, Institut Curie, Paris, France – Mechanics of blastocyst morphogenesis.

Antoine JEGOU, Institut Jacques Monod, Paris, France – Regulation of actin filament dynamics by proteins and mechanical stress.

Marie-Emilie TERRET, Collège de France, Paris, France – Cortical tension participates in chromosome alignment in mouse oocytes.

Anne-Cécile REYMANN, IGBMC, Strasbourg, France – Cortical flow aligns actin filaments to form a furrow.

Ulrich SCHWARZ, université d’Heidelberg, Allemagne – Traction force microscopy.

Sara Annika WICKSTROM, Max Planck Institute for Biology of Ageing, Cologne, Allemagne – Mechanoadaptation at the nucleoskeleton-chromatin interface.

 

Module 4 – Analyse et modélisation des dynamiques et interactions moléculaires en cellule vivante

Diego KRAPF, Colorado State Univ., USA – First passage times, ergodicity and ageing for single-particle tracking in biological membranes.

Erdinc SEZGIN, Radcliffe Medical Institute, Oxford Univ., Grande-Bretagne – Elucidating the nanoscale architecture of the plasma membrane with super-resolution spectroscopy.

Davide MAZZA, San Raffaele Scientific Institute, Milan, Italie – Live-cell single molecule imaging of transcription factors: past, present and future challenges.

Thomas GREGOR, Institut Pasteur, Paris, France – Challenges measuring genetic network activity in living embryos.

Xavier DARZACQ, Berkeley univ., USA – Titre à venir.

Maria GARCIA-PARAJO, ICFO, Barcelona, Espagne – Linking nano- and meso-scale compartmentalization of the plasma membrane using high density single particle tracking tools.

 

Module 5 – Nouveaux agents de contraste, biosenseurs, sondes, nano-vecteurs, photophysique des fluorophores

Boris VAUZEILLES, ICMM, Orsay, France – Click Chemistry for Imaging.

Mayeul COLLOT, université de Strasbourg, Strasbourg, France – Insight in Fluorescent Lipid Probes, from plasma membrane to lipid droplets.

Arnaud GAUTIER, ENS, Paris, France – Spying on cells with glowing chemical-genetic hybrids.

Peter DEDECKER, University of Leuven, Belgique – Imaging of cell structure and activity using SOFI imaging.

Ulrike ENDESFELDER, Max Plack Institute, Marburg, Allemagne – Titre à venir.

Yann BRETONNIERE, ENS, Lyon, France – Titre à venir.

 

Module 6 – Ondes sur le vivant, imagerie en milieux très diffusants (collab. GDR « Ondes »)

Ce module est proposé, comme lors de la session 2014, en collaboration avec le GDR Ondes. Il a pour but d’étendre les techniques d’imagerie du vivant à d’autres modalités que l’optique (ultrasons, etc.), mais aussi d’apporter de nouveaux concepts issus du contrôle spatio-temporel des ondes (imagerie à travers des milieux très diffusant).

Thomas DEHOUX, ILM, Lyon, France – Brillouin imaging in life sciences: from single cell to tissues.

Daniel RAZANSKY, Technical Univ. Munich, Allemagne – Multi-spectral optoacoustic tomography (MSOT).

Sylvain GIGAN, LKB, Paris, France – Waves manipulation for imaging in scattering media.

Françoise PEYRIN, CREATIS, Lyon, France – 3D X-ray microscopy by absorption and phase Computerized Tomography.

Benjamin JUDKEWITZ, Univ. Charité, Berlin, Allemagne – Titre à venir.

Hervé RIGNEAULT, Institut Fresnel, Marseille, France – Nonlinear endoscopes.

 

Module 7 – Microscopie à haut contenu : HCS, automatisation, microscopie multimodale

Christian CONRAD, Heidelberg, Allemagne – Single cell imaging and sequencing.

Anatole CHESSEL, LOB, Palaiseau, France – Titre à venir.

Anne BEGHIN, IINS, Bordeaux, France – How Localization-based resolution imaging meets High Content Screening  ?

Catherine PICART, LMGP, Grenoble, France – High throughput using biomaterials and biomimetic surfaces.

Thomas WALTER, CBIO, Mines ParisTech, Paris, France – Machine Learning for Bioimaging.

Nathalie PICOLLET D’HAHAN, BIG, Grenoble, France – Titre à venir.

 

Liste des séminaires (invited talks list)

Robert E. CAMPBELL, Tokyo, Japan – Engineering new colors and functions of optogenetic indicators and actuators for biological microscopy

Ji-Xin CHENG, Boston univ., USA – Label-free Chemical Microscopy: Unveiling hidden signatures in living systems for precision diagnosis and treatment

Teng-Leong CHEW, Janelia Farm, USA – Imaging life with the new frontiers in spatial and temporal resolution

Stéphane DIEUDONNE, France – titre à venir

Christophe LETERRIER, Aix-Marseille univ., Marseille, France – The axonal cytoskeleton at the nanoscale

Marta GIACOMELLO, univ. of Padova, Padova, Italy – Imaging mitochondrial dynamics and functionality: from low to high throughput imaging

Thorsten WHOLAND, National University of Singapore – titre à venir.

Philip TINNEFELD, Ludwig Maximilians-Universität München, Allemagne – DNA origami tools for single-molecule biophysics

Chris XU, Cornell Univ., USA – In vivo Multiphoton Microscopy of the Mouse Brain

Vincent BONTEMS, CEA LARSIM, Saclay, France – Boite noire vs boite noire. Lutter contre l’opacité épistémologique

Anna KRESHUK, EMBL, Germany – Machine learning and automation of (bio)image analysis

Lydia DANGLOT, CPN, Paris, France – Statistical colocalisation analysis from conventional to super resolution microscopy : tips and trick for molecular mapping

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