AI expérimentation et instrumentation biologiques


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  • Ingénieur, assistant-ingénieur, technicien
  • PARIS

Contexte et environnement de travail

Reconnue par quatre tutelles, l’AP-HP, le CNRS, l’Inserm et l’Université Paris Descartes, la SFR Necker a pour mission de développer et d’optimiser les plateformes technologiques et de contribuer à l’animation scientifique du site Necker. Douze plateformes sont à ce jour opérationnelles et pour certaines ouvertes aux chercheurs et partenaires en Ile-de-France.

La SFR Necker fédère deux instituts, l’Institut des maladies génétiques Imagine et l’Institut Necker Enfants Malades INEM, et neuf pôles hospitaliers. L’Institut Imagine regroupe 25 équipes concentrant plus particulièrement leurs activités sur l’étude des maladies rares constitutionnelles ; l’Institut Necker Enfants Malades, l’INEM, comporte 17 équipes réparties dans deux départements « Biologie cellulaire, croissance et signalisation » et « Immunologie, infectiologie et hématologie ».

La Plateforme d’Imagerie Cellulaire est spécialisée dans la visualisation et l’analyse de la structure et de processus dynamiques au niveau cellulaire et tissulaire jusqu’à l’échelle de l’organisme. Elle a pour mission de mettre à disposition des biologistes et des médecins (internes ou externes à l’Institut) des instruments d’optique et des outils d’analyses de pointe accompagnés d’une expertise.
Elle comprend aujourd’hui 3 personnes : 1 IR Inserm et 2 IE Inserm.

Les équipements d’acquisition et d’analyse présents sont les suivants :
– 4 microscopes confocaux mono-photon dont un système FLIM TCSPC et un STED
– 1 microscopes multi-photon
– 1 microscopes spinning-disk
– 1 vidéo-microscope avec module TIRF
– 2 microscopes à champ-large
– 1 microscopes à illumination structurée
– 1 microscope à feuille de lumière
– 3 stations de traitement et d’analyse d’image (Imaris, Huygens, Icy, ImageJ,…)

Missions

Au sein de la plateforme d’imagerie et en coordination avec le responsable, l’Assistant Ingénieur en expérimentation et instrumentation biologiques participera au bon fonctionnement du service, avec les missions suivantes :
–       Conseiller, assister, former, les utilisateurs sur les différents systèmes d’acquisition ainsi que sur le traitement des images obtenues,
–       Participer au fonctionnement général de la PF,
–       Prendre en charge le pôle transparisation,

Activités principales

–       Prendre en charge les projets en transparisation d’organes et acquisition d’images en microscopie à feuille de lumière :
o   Mettre au point des protocoles techniques de transpiration, de marquage et test sur différents types d’échantillons (organes entiers, biopsies, organoïdes…)
o   Former les utilisateurs sur le microscope à feuille de lumière
o   Accompagner les utilisateurs dans la mise en œuvre de cette technique
o   Accompagner les utilisateurs sur le traitement des images obtenues en microscopie à feuille de lumière
o   Rédiger des protocoles à destination des utilisateurs après mise au point et validation de ceux-ci.

–       Former les utilisateurs du service (doctorants, chercheurs, ingénieurs et techniciens) aux différents systèmes d’imagerie disponible afin de les rendre autonome
–       Assurer l’entretien, la maintenance et le bon fonctionnement des appareils de microscopie
–       Superviser et gérer l’utilisation des appareils : réservation du planning, liaison SAV…
–       Appliquer et faire appliquer le règlement de l’utilisation du plateau et les règles d’hygiène et sécurité
–       Gestion du laboratoire (stocks, commandes…).

Compétences requises nécessaires à la tenue du poste

–         Connaissances théoriques et pratiques en microscopie photonique et en particulier la microscopie à feuille de lumière
–         Connaissances théoriques et pratiques en préparation d’échantillons, immunomarquage, immunofluorescence sur gros échantillons (organe entier, biopsie, organoïde…)
–         Connaissances générales en biologie
–         Connaissance pratique des logiciels dédiés à l’acquisition d’images (NIS, LASAF, Zen…)
–         Connaissance pratique des logiciels de visualisation et traitements d’images (ImageJ, Imaris, Huygens…)
–         Bon niveau d’expression et de compréhension écrites et orales en anglais (requis pour communiquer avec les utilisateurs et fournisseurs anglophones)
–         Capacité d’analyse et de synthèse

Aptitudes

–         Bon sens relationnel avec de bonnes qualités pédagogiques
–         Capacité de travail en équipe
–         Rigueur technique et sens de l’organisation
–         Motivation et enthousiasme
–         Autonomie
–         Curiosité intellectuelle

Spécificité(s) / Contrainte(s)du poste

–       Travail en pièce dans le noir
–       Travail sur écran
–       Manipulation de produits chimiques
–       Flexibilité des horaires.

Expérience souhaitée
Une expérience dans le domaine de la microscopie et  en transparisation est fortement souhaitée

Diplôme(s) souhaité(s)
BTS ou DUT.

Salaire
Sur grille de salaires de la fonction publique

Prise de fonction
Janvier 2020 – 1 an renouvelable

Contact pour information
Meriem GARFA-TRAORE
Responsable de la plateforme d’imagerie cellulaire de la SFR Necker
meriem.garfa@inserm.fr

Pour postuler, envoyez votre CV et votre lettre de motivation par e-mail à meriem.garfa@inserm.fr