CDD IE plateforme d’imagerie cellulaire

Profil de poste IE expérimentation et instrumentation biologiques – PF Imagerie Necker

Contexte et environnement de travail
Reconnue par quatre tutelles, l’AP-HP, le CNRS, l’Inserm et l’Université Paris Descartes, la SFR Necker a pour mission de développer et d’optimiser les plateformes technologiques et de contribuer à l’animation scientifique du site Necker au profit des instituts Imagine et INEM.
Douze plateformes sont à ce jour opérationnelles et pour certaines ouvertes aux chercheurs et partenaires en Ile-de-France.

La Plateforme d’Imagerie Cellulaire est spécialisée dans la visualisation et l’analyse de la structure et de processus dynamiques au niveau cellulaire et tissulaire jusqu’à l’échelle de l’organisme. Elle a pour mission de mettre à disposition des biologistes et des médecins (internes ou externes à l’Institut) des instruments d’optique et des outils d’analyses de pointe accompagnés d’une expertise.

Elle comprend aujourd’hui 3 personnes : 1 IR Inserm et 2 IE Inserm.

Les équipements d’acquisition et d’analyse présents sont les suivants :
– 4 microscopes confocaux mono-photon dont un système FLIM TCSPC et un STED
– 1 microscope multi-photon
– 1 microscope spinning-disk
– 1 vidéo-microscope avec module TIRF
– 2 microscopes champ-large
– 1 microscope à illumination structurée
– 1 microscope à feuille de lumière
– 3 stations de traitement et d’analyse d’image (Imaris, Huygens, Icy, ImageJ,…)

Missions
Au sein de la plateforme d’imagerie et en coordination avec le responsable, l’ ingénieur – e en expérimentation et instrumentation biologiques participera au bon fonctionnement du service, avec les missions suivantes :
–       Conseiller, assister, former, les utilisateurs sur les différents systèmes d’acquisition ainsi que sur le traitement des images obtenues,
–       Choisir, adapter et développer de nouvelles stratégies d’acquisition et d’analyse en réponse aux besoins des utilisateurs,
–       Participer au fonctionnement général de la PF,
–       Prendre en charge le pôle transparisation,
–       Participer à la gestion du parc d’instruments et à son évolution,
–       Assurer le bon fonctionnement des appareils de microscopie,

Activités principales
–       Prendre en charge les projets en transparisation d’organes et acquisition d’images en microscopie à feuille de lumière :
–       Choisir et adapter les systèmes d’acquisition d’images aux problématiques des expérimentations de recherche
–       Former les utilisateurs du service aux différents systèmes d’imagerie disponibles afin de les rendre autonome
–       Rédiger des notes techniques sur les différents systèmes et approches expérimentales
–       Assurer l’entretien, la maintenance et le bon fonctionnement des appareils
–       Superviser et gérer l’utilisation des appareils : réservations du planning, liaison SAV…
–       Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine de l’imagerie
–       Participer à des réseaux professionnels d’échanges de savoirs et de savoir-faire
–       Diffuser et valoriser les résultats des développements technologiques
–       Appliquer et faire appliquer le règlement de l’utilisation de la PF et les règles d’hygiène et sécurité́
–       Gestion du laboratoire (stocks, commandes…).

Compétences requises nécessaires à la tenue du poste
–         Connaissances théoriques et pratiques en microscopie photonique
–         Connaissances théoriques et pratiques en préparation d’échantillons, immunomarquage, immunofluorescence sur gros échantillons (organe entier, biopsie, organoïde…)
–         Connaissances générales en biologie
–         Connaissance pratique des logiciels dédiés à l’acquisition d’images (NIS, LASAF, Zen…)
–         Connaissance pratique des logiciels de visualisation et traitements d’images
–         Bon niveau d’expression et de compréhension écrites et orales en anglais
–         Capacité d’analyse et de synthèse

Aptitudes
–         Bon sens relationnel avec de bonnes qualités pédagogiques
–         Capacité de travail en équipe
–         Rigueur technique et sens de l’organisation
–         Motivation et enthousiasme
–         Autonomie

Spécificité(s) / Contrainte(s)du poste
–       Travail en pièce dans le noir
–       Travail sur écran
–       Manipulation de produits chimiques

Expérience souhaitée
Une expérience dans le domaine de la microscopie et en transparisation est fortement souhaitée

Diplôme(s) souhaité(s)
BAC+3 minimum

Salaire
Sur grille de salaires de la fonction publique

Prise de fonction
Janvier 2020 – 1 an renouvelable

Contact pour information
Meriem GARFA-TRAORE
Responsable de la plateforme d’imagerie cellulaire de la SFR Necker
meriem.garfa@inserm.fr