Activités pédagogiques
L’école thématique MiFoBio est un lieu propice aux échanges et à l’expérimentation scientifique au travers de nombreuses activités pédagogiques. Elle apporte une offre de contenu riche et diversifiée. Cette page regroupe une description et les liens de présentation des différentes activités pédagogiques présentes au cours de la semaine, souvent en parallèle les unes des autres (sauf les cours et séminaires).
Cours et Séminaires
Le cœur des enseignements de l’école est organisée autour de 6 modules thématiques et un module initial donnant les concepts fondamentaux. Ces modules rassemblent 4 à 6 cours et sont complétés par des séminaires et enseignements transversaux (voir planning).
Cette année, nous fêtons les 20 ans de la structuration de la communauté en GDR. A cette occasion, des séminaires spécifiques mettront en lumière les développements majeurs de ces 20 dernières années.
Parcours thématiques
Les parcours regroupent des modules, des ateliers et des tables rondes sur un thème commun et se concluent par une table ronde bilan. Cela permet aux participants d’identifier plus efficacement les ateliers qui correspondent à leurs intérêts et de suivre le parcours souhaité partiellement ou intégralement. Il existe 8 parcours:
Ce parcours vise à rassembler les cours et ateliers animés par une même stratégie : l’amélioration de la résolution. Du fait de la barrière de la diffraction, différentes stratégies ont été élaborées afin d’améliorer la résolution. Certaines techniques dites de Super-résolution (SIM, STED, STORM) peuvent ainsi améliorer la résolution grâce à des développement optiques ou de traitement de données. Ces méthodes nécessitent une certaine expertise et des machines onéreuses. Plus récemment, les techniques de microscopie d’expansion qui consistent à faire « gonfler » l’échantillon, afin de l’observer avec des méthodes traditionnelles (confocal ou autres) connaissent un essor considérable. Ce parcours regroupe donc ces différentes stratégies afin que vous puissiez vous faire votre opinion sur les différentes alternatives envisageables. Le parcours est associé à une table ronde animée par les membres des groupes de travail du RTmfm : GT expansion, GT STED, GT STORM qui toute l’année se retrouvent pour améliorer leurs résultats. Les « super-résolutionnistes » prônent la non distorsion des échantillons, les expansionnistes prônent la facilité de la technique et l’accessibilité des confocaux. N’hésitez pas à venir débattre de tout cela afin d’animer ce match passionnant !”
Module associé : Module 2, Quantification à l’échelle nanométrique et études des assemblages supra-moléculaires.
Ateliers et tables rondes de ce parcours :
- A008 : Automated reconstruction of massive amount of super-resolution single particle trajectories
- A010 : Lifetime STED microscopy to resolve the organization of the Golgi apparatus at super-resolution in plant samples
- A018 : 3D Single Molecule Localization Microscopy on reconstituted systems: purified proteins and model membranes
- A020 : Whole workflow for plant expansion microscopy: from sample preparation to image analysis
- A024 : Obtenir la PSF d’un système de microscopie de fluorescence
- A029 : 3D STED microscopy for nanoscopic imaging of virus-host cell interactions.
- A038 : Event-based Single-Molecule Localization Microscopy for fast and dense high resolution imaging
- A044 : Structured illumination microscopy with a chip based light source
- A059 : Expansion microscopy on mouse brain tissue slices: gain of resolution allowing deciphering of synapse substructure
- A064 : DNA-PAINT imaging of intact Drosophila muscles
- A068 : Microscopie à expansion sur différents échantillons infectieux (Autophagie norovirus / toxoplasme)
- A072 : La microscopie par dSTORM pour cartographier les crêtes mitochondriales
- A078 : STED-FLIM, apport du temps de vie de fluorescence dans les techniques de STED au niveau multi-couleur, 3D et vivant
- A082 : How to reach mitochondrial inner membrane remodeling by super resolution live imaging
- A085 : Super-resolved Imaging based on RIM technology
- A086 : Eternity-Plus buffer for 3 color Nanoscale imaging in depth.
- A092 : Single Molecule Localization Microscopy and use of calibration tools to unravel EVs composition and 3D morphology at a single-vesicle level
- A095 : Contribution of expansion microscopy for studying organs: Example of lymph node
- A098 : Optimizing fluorophores and data acquisition parameters in SMLM and sptPALM in silico using the SMIS simulator
- A100 : Optimizing imaging schemes for PALM and single particle tracking in bacteria
- A109 : Microscopie d’expansion: Trucs et astuces pour l’analyse des compartiments cellulaires dans les cellules de mammifères et dans la levure
- A120 : Nanoscale imaging of the Toxoplasma gondii microtubules network using Expansion microscopy and 3D-STED
- A122 : COLORME/FLUOGAN : Super-resolution in fluorescence microscopy with standard setup.
- A135 : Single Molecule Orientation and Localization Microscopy (SMOLM) using polarized super resolution imaging and PSF engineering
- A143 : Coupling Expansion to STED microscopy for centriole protein imaging
- A144 : Imaging contact sites in neuronal and epithelial cells by multicolor STED microscopy
- A147 : Multi-target imaging in 3D single molecule localization microscopy with a single laser : Spectral vs Flux demixing
- A154 : Adaptable excitation field for enhanced single-molecule regime in dSTORM
- A159 : Metal-Induced Energy Transfer Single-Molecule Localization Microscopy (MIET-SMLM)
- TR171-A challenge in super-resolution: choosing the best technique for your biological question. Inter-WG organized debate.
Ce parcours vise à rassembler les cours et ateliers préoccupés par l’imagerie des échantillons épais : cela inclus les très gros organoïdes, les tranches organotypiques, les tissus, jusqu’au petit animal. Pour cela toute une panoplie de stratégies est disponible : les stratégies optiques (les tomographies, l’imagerie rapide par feuille de lumière, la gestion du front d’onde par des optiques adaptatives), des stratégies de préparations d’échantillons (les nouveaux contrastes, la transparisation, fabrication de support pour ne pas écraser l’échantillon, … Le parcours est associé à une table ronde animée par les animateurs des modules ondes, modules multicellulaires, et nanoscopie du GDR et de la pièce de culture/préparation des échantillons. Le but étant de faire débattre les physiciens, les biologistes et les chimistes afin d’identifier les problèmes et les solutions accessibles. N’hésitez pas à venir faire votre marché lors de cette table ronde.
Modules associés : Module 4, Waves on living organisms : New imaging techniques for organisms, Module 5, Imaging self-organizing biological systems, from cell to organ.
Ateliers et tables rondes de ce parcours :
- A002 : Home-made wavefront microscopy: working principle and application to dry mass measurements of bacteria and neurons in culture, with a sub-picogram sensitivity.
- A007 : Label-free correlative microscopy of 3D samples: from light sheet to confocal microscopy
- A012 : Imaging transcription at the single cell level during zebrafish development
- A016 : Parallel long-term live imaging of developing C. elegans larvae with microfluidics
- A020 : Whole workflow for plant expansion microscopy: from sample preparation to image analysis
- A031 : Fast 2D and 3D imaging of cells and spheroids for quantitative analysis on high-speed fluorescent light-Sheet microplate cytometer.
- A036 : High content 3D imaging of small specimens and automatic analysis in the context of screening applications
- A037 : Whole brain single cell resolution study of the mouse brain using iDISCO, light sheet microscopy and the ClearMap2 software.
- A043 : A practical review of several 3D-culture methods for the generation of hollow or solid organoids/spheroids with a unique cell-type, how environment matters
- A051 : Upcycling 3D Printers for bioimaging
- A052 : Two photon imaging of plant tissues with photo switchable Dronpa
- A056 : Beginner’s guide to the fabrication and use of microfluidic organ-on-chip systems
- A059 : Expansion microscopy on mouse brain tissue slices: gain of resolution allowing deciphering of synapse substructure
- A069 : In Resin Fluorescence (IRF) Correlative Light and Electron Microscopy (CLEM) for plant tissues
- A080 : Photoacoustic and fluorescence imaging through a single multimode fiber using wavefront shaping
- A081 : Fast imaging of 3D models for Hight Content Screening quantitative analysis in 3D
- A082 : How to reach mitochondrial inner membrane remodeling by super resolution live imaging
- A083 : Optimization of 3D High Content Screening (HCS) acquisitions on thick samples
- A085 : Super-resolved Imaging based on RIM technology
- A095 : Contribution of expansion microscopy for studying organs: Example of lymph node
- A103 : Single-shot polarimetric and quantitative phase imaging
- A106 : Quantitative phase imaging with a diffuser
- A108 : Simultaneous multiplexed staining of the infarcted area and Connexin-43 on wide thick heart sections
- A114 : Exploring the Impact of Laser Power and Pulse Duration on Two-Photon Microscopy
- A118 : Clearing and 3D imaging of mesenteric adipose tissue of rat
- A120 : Nanoscale imaging of the Toxoplasma gondii microtubules network using Expansion microscopy and 3D-STED
- A126 : Cell and tissue manipulation with ultrashort infrared pulses in multi-view light sheet microscopy
- A144 : Imaging contact sites in neuronal and epithelial cells by multicolor STED microscopy
- A145 : Label-free imaging of entire organisms using a mobile optical coherence microscopy platform
- A146 : Label-free imaging of tissues and collagen with high-definition quantitative phase imaging
- A148 : Identification de nanoparticules et de virus-like-particles avec la microscopie de phase quantitative
- A149 : Label-free highly multimodal nonlinear micro-endoscopy: demonstration and practice
- A150 : Adaptive optics two-photon fluorescence microscopy for in depth bioimaging
- A151 : Hands-on light sheet microscopy with Flamingo, the shareable custom research microscope
- A153 : Customized Mounting of Cleared Organs (Brain, Ovary and Placenta) and organoids using CUBIC and Lighsheet imaging
- A155 : Compact, simple and versatile light-sheet fluorescence microscopy module for long-term 1P/2P functional imaging.
- TR183 : Quand les physiciens rencontrent les biologistes: de nouvelles solutions d’imagerie pour l’imagerie profondeur à haute résolution mais sans phototoxicité.
Ce parcours vise à rassembler les cours et ateliers portants sur les « oïdes » au sens large, c’est à dire les organoïdes (ayant la capacité d’assurer une fonction intégrée comme pourrait le faire un organe), mais aussi les sphéroïdes (agrégats cellulaires n’arborant pas forcement les fonctions d’un organe).
Associé à un petit challenge : des échantillons standardisés seront disponibles pendant la semaine de Mifobio en pièce de culture. Ils seront distribués aux participants voulant relever le challenge de les imager sur le ou les systèmes de leur choix. Les meilleurs stratégies et images générées (profondeur, rapidité,..) seront discutées au cours de la table ronde. N’hésitez pas à venir relever ce challenge !!
Seront abordés également : les problèmes rencontrés lors de la mise en culture 3D en salle de culture (A043), le TP microfluidique pour la bio fabrication (A056), les tranches organotypique, les embryons,…”
Module associé : Module 5, Imaging self-organizing biological systems, from cell to organ
Ateliers et tables rondes de ce parcours :
- A003 : Automated acquisition of organoids in high-throughput assays for cancer research
- A007 : Label-free correlative microscopy of 3D samples: from light sheet to confocal microscopy
- A012 : Imaging transcription at the single cell level during zebrafish development
- A013 : ZERO CODE MACHINE & DEEP LEARNING
- A016 : Parallel long-term live imaging of developing C. elegans larvae with microfluidics
- A020 : Whole workflow for plant expansion microscopy: from sample preparation to image analysis
- A031 : Fast 2D and 3D imaging of cells and spheroids for quantitative analysis on high-speed fluorescent light-Sheet microplate cytometer.
- A043 : A practical review of several 3D-culture methods for the generation of hollow or solid organoids/spheroids with a unique cell-type, how environment matters
- A051 : Upcycling 3D Printers for bioimaging
- A056 : Beginner’s guide to the fabrication and use of microfluidic organ-on-chip systems
- A059 : Expansion microscopy on mouse brain tissue slices: gain of resolution allowing deciphering of synapse substructure
- A069 : In Resin Fluorescence (IRF) Correlative Light and Electron Microscopy (CLEM) for plant tissues
- A081 : Fast imaging of 3D models for High Content Screening quantitative analysis in 3D
- A082 : How to reach mitochondrial inner membrane remodeling by super resolution live imaging
- A083 : Optimization of 3D High Content Screening (HCS) acquisitions on thick samples
- A085 : Super-resolved Imaging based on RIM technology
- A095 : Contribution of expansion microscopy for studying organs: Example of lymph node
- A108 : Simultaneous multiplexed staining of the infarcted area and Connexin-43 on wide thick heart sections
- A120 : Nanoscale imaging of the Toxoplasma gondii microtubules network using Expansion microscopy and 3D-STED
- A145 : Label-free imaging of entire organisms using a mobile optical coherence microscopy platform
- A149 : Label-free highly multimodal nonlinear micro-endoscopy: demonstration and practice
- A151 : Hands-on light sheet microscopy with Flamingo, the shareable custom research microscope
- A153 : Customized Mounting of Cleared Organs (Brain, Ovary and Placenta) and organoids using CUBIC and Light-sheet imaging
- TR184-Assemblages multicellulaires, -oïdes, tranches, tissus natifs et biofabriqués : où en est-on et où va-t-on ?
Les sites de contact entre différents organelles (par exemple entre le réticulum avec la membrane plasmique, ou le réticulum avec les mitochondries ou le réticulum avec les endosomes, …) sont des sites de multiples échanges de molécules et de signalisation. Les sites de contact sont des plateformes fonctionnelles composées de deux membranes séparant 3 compartiments. Ils affinent le transport des métabolites, des ions, des lipides qui donnent naissance à des signaux entre cellules, organites, matrice extracellulaire et organites. La combinaison entre la microscopie électronique et photonique, les sondes chimiques et biologiques ouvre une nouvelle compréhension des sites de contact.
Modules associés : Module 1: From molecule to microscope: Labeling strategies, probes and contrasts, Module 2: Nanoscale quantification and studies of supramolecular assemblies, Module 3: Molecular dynamics and interactions in cells and tissues: experimentation and modeling
Ateliers et tables rondes de ce parcours :
- A015 : Fluorescence-based techniques to study ER–mitochondria contact sites
- A025 : AFM and FluidFM to probe the hydrophobic properties of living cell surfaces
- A027 : Single-cell force spectroscopy to probe cell-cell interactions using AFM and AFM combined with microfluidics
- A032 : Force spectroscopy on virus-like particle producing cells using atomic force microscopy
- A068 : Microscopie à expansion sur différents échantillons infectieux (Autophagie norovirus / toxoplasme)
- A072 : La microscopie par dSTORM pour cartographier les crêtes mitochondriales
- A082 : How to reach mitochondrial inner membrane remodeling by super resolution live imaging
- A105 : FRET SRRF: where super-resolution meets protein activation
- A113 : Multiplexed biosensor imaging to visualize and quantify signaling pathways in 2D and 3D cellular models.
- A115 : Monitoring calcium responses of moving T cells in fresh tissue slices by multiphoton microscopy
- A123 : A simple way to enhance TIRF microscopy using dedicated coverslips
- A144 : Imaging contact sites in neuronal and epithelial cells by multicolor STED microscopy
Comme son nom l’indique, il s’agit d’un parcours dédié aux spécificités de l’imagerie des plantes : stratégies de marquages, comment gérer l’autofluorescence, …
Module associé : Module 1, From molecule to microscope: Labeling strategies, probes and contrasts.
Ateliers et tables rondes de ce parcours :
- A020 : Whole workflow for plant expansion microscopy: from sample preparation to image analysis
- A028 : Microfluidics and microscopy for plant biology
- A052 : Two photon imaging of plant tissues with photo switchable Dronpa
- A069 : In Resin Fluorescence (IRF) Correlative Light and Electron Microscopy (CLEM) for plant tissues
- A091 : Fluorescence to measure light intensity
- A145 : Label-free imaging of entire organisms using a mobile optical coherence microscopy platform
- TR169-Fluorophores pour les plantes
Ce parcours vise à rassembler les cours et ateliers préoccupés par l’imagerie de phase qui permet d’accéder à des paramètres physiologiques sans forcément utiliser la fluorescence en évitant ainsi toute phototoxicité.
Module associé : Module 4, Waves on living organisms: New imaging techniques for organisms.
Ateliers et tables rondes de ce parcours :
- A002 : Home-made wavefront microscopy: working principle and application to dry mass measurements of bacteria and neurons in culture, with a sub-picogram sensitivity.
- A106 : Quantitative phase imaging with a diffuser
- A146 : Label-free imaging of tissues and collagen with high-definition quantitative phase imaging
- A148 : Identification de nanoparticules et de virus-like-particles avec la microscopie de phase quantitative
- TR183 : Quand les physiciens rencontrent les biologistes: de nouvelles solutions d’imagerie pour l’imagerie profondeur à haute résolution mais sans phototoxicité
Ce parcours vise à rassembler les cours et ateliers préoccupés par l’analyse d’image. Il comprend les stratégies de segmentations conventionnelles, d’intelligence artificielle, mais aussi de visualisations multidimensionnelles.
Prémodules : Bases en analyse d’image; Introduction à l’apprentissage machine pour le traitement d’images.
Ateliers et tables rondes de ce parcours :
- A001 : Segmentation and classification under Napari
- A003 : Automated acquisition of organoids in high-throughput assays for cancer research
- A004 : Unmixing of spectrally identical fluorescent proteins by lifetime imaging
- A008 : Automated reconstruction of massive amount of super-resolution single particle trajectories
- A013 : ZERO CODE MACHINE & DEEP LEARNING
- A014 : DEEP NAPARI
- A034 : 3D Deconvolution
- A035 : Cellpose 2.0 and TrackMate: A powerful combination for effortless and accurate analysis of live cells in phase microscopy
- A036 : High content 3D imaging of small specimens and automatic analysis in the context of screening applications
- A040 : Segmentation with machine learning solution Cellpose for absolute beginners
- A042 : Deep Learning for Bioimage Analysis: Concepts and Hands-on Neural Networks Training with a Critical Approach
- A045 : Coordinate-based quantification of multidimensional and multicolor single-molecule localization microscopy data
- A046 : An easy-to-use deep learning method for 3D semantic segmentation
- A049 : Deep Learning Bootcamp Desk
- A054 : Virtual reality for multidimensional data visualization and analysis
- A058 : Beginners initiation of whole slide image 2D analysis. From tissue to cells with QuPath
- A060 : Deep learning annotations for 2D model creation : Tips / Tricks and Model’s Quality Control
- A067 : Nuclei segmentation with StarDist, a user-friendly deep-learning tool for the biologist
- A074 : Integrated machine learning for scanned slides analysis with QuPath
- A087 : DeepIcy: A user-friendly plugin to use latest Deep Learning methods in Icy
- A089 : Deep Learning for fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM)
- A090 : Batch processing images from OMERO in Fiji
- A093 : MorphoNet : How to segment a 3D dataset in just a few clicks?
- A101 : Slide scanner use case: from the acquisition to the analysis of a stack of 2D slices registered onto a 3D reference brain atlas
- A107 : Roboscope prototype for smart automated microscopy
- A110 : Analysis of multiplexed whole slide images with QuPath and Cytomap
- A116 : Analysis of the 3D spatial organization of cells and molecules with FIJI and Napari
- A117 : Orchestrating complex bioimage workflows- leading up to smart microscopy
- A121 : Phasor analysis of Fluorescence Lifetime Microscopy (FLIM)
- A128 : 3D Image Analysis Flash Tutorials: 3D reconstruction, visualization tools and movie creation
- A129 : 3D Image Analysis Flash Tutorials: Machine learning and object classification in routine
- A130 : 3D Image Analysis Flash Tutorials: Cells quantification: model cells as mesh objects to obtain their counts, volumes and morphologies
- A131 : 3D Image Analysis Flash Tutorials: 3D co-distribution analysis for Neurobiology
- A132 : 3D Image Analysis Flash Tutorials: Deciphering immune cell shape over time
- A133 : 3D Image Analysis Flash Tutorials: Neuron tracing using Machine Learning
- TR168 – Intelligence Artificielle dans les métiers de l’imagerie métiers de l’imagerie
- TR173 – IA KAFOKON : IA pour l’analyse d’images
A058 : Beginners initiation of whole slide image 2D analysis. From tissue to cells with QuPath
A074 : Integrated machine learning for scanned slides analysis with Qupath
A110 : Analysis of multiplexed whole slide images with QuPath and Cytomap
Ateliers de ce parcours :
- A014 : DEEP NAPARI
- A040 : Segmentation with machine learning solution Cellpose for absolute beginners
- A042 : Deep Learning for Bioimage Analysis: Concepts and Hands-on Neural Networks Training with a Critical Approach
- A058 : Beginners initiation of whole slide image 2D analysis. From tissue to cells with QuPath
- A060 : Deep learning annotations for 2D model creation : Tips / Tricks and Model’s Quality Control
- A067 : Nuclei segmentation with StarDist, a user-friendly deep-learning tool for the biologist
- A074 : Integrated machine learning for scanned slides analysis with Qupath
- A110 : Analysis of multiplexed whole slide images with QuPath and Cytomap
Ateliers pratiques
Incontournables de Mifobio, les ateliers sont proposés par des participants dans le but de partager des savoirs faire par la pratique en rendant les autres participants acteurs de l’atelier autour d’une machine ou en salle informatique. Les équipements sont soit mis à disposition par nos partenaires industriels, soit apportés par des académiques (systèmes home-made). D’une durée d’1h45, ils sont limités à 20 personnes et font l’objet d’une inscription obligatoire en amont de MiFoBio via le site Atelier http://ateliers-mifobio.fr
Les ateliers ont lieu tout au long de la semaine, les après-midi et soirs, en sessions parallèles.
Retrouvez le listing de tous les ateliers dans le fichier PDF suivant :
Tables rondes (TA), Cours Avancés (CA) et Mini-Symposium (MS)
Autres incontournables de Mifobio, ils permettent d’échanger en toute décontraction sur une thématique donnée. Les TR sont un espace moins formalisé de discussion alors que le format CA ressemble plus à un cours interactif avec une présentation plus formelle mais très ouverte aux discussions. Quant aux MS, ils sont liés à des modules et donc organisés autour de thématiques. Ils permettent la présentation de travaux par de jeunes chercheurs et d’échanger autour de verrous techniques.
Les tables rondes, cours avancés et mini-symposia ont lieu en même temps que les créneaux ateliers. Il y en a 25 de prévus sur la semaine. Il est donc recommandé de s’inscrire sur le site Ateliers pour les intégrer dans les plannings individuels http://ateliers-mifobio.fr
CA187-Temps de vie de fluorescence |
CA188-Microscopie de fluorescence polarisée, quelle utilité? |
CA189-Imagerie de phase et tomographique |
Autres actions de formation
Bar à Image
Le Bar à image (BAI) est un lieu de rencontre entre des participants rencontrant des difficultés en traitement et analyse d’image, et des experts présents pour résoudre ces problèmes.
Les Bar à Image ont lieu de 14h à 16h, les 11, 12, 13, 15 et 16 novembre. L’accès est libre et sans inscription (espace “Lounge Mer”)
DeepLearning Boot Camp
Le DeepLearning Boot Camp (DBC) permet d’accompagner les participants dans l’accessibilité aux outils de deep learning avancés. Les experts sur place aide à l’installation du nécessaire (bibliothèque CUDA, installation GPU) aux participants qui le désirent.
Le DeepLearning Boot Camp a lieu en parallèle des 2 sessions posters (jeudi 9 novembre et vendredi 10 novembre à 21h30) et de 14h à 16h, les 11, 12, 13, 15 et 16 novembre, en parallèle des BAI. L’accès est libre et sans inscription. (espace “Lounge Terre”)
3D Image Analysis Flash Tutorials
Il s’agit de tutoriels en format court (30 min) pour découvrir les astuces pour le traitement et l’analyse de vos images en 3D avec Imaris.
Le programme est consultable ci-dessous :
Les 3D Flash Tutorials ont lieu les 11, 12, 13, 14, 15, et 16 novembre, de 13h30 à 14h00. L’accès est libre et sans inscription, dans la limite des places disponibles. (salle Bergerie)
Fab-Lab
De la conception assistée par ordinateur à la programmation Arduino en passant par l’impression 3D, le Fab-Lab regroupe un ensemble de techniques et de compétences au travers d’experts dédiés, pour accompagner les projets et idées de chacun.
Le Fab-Lab est en accès libre, en plus des créneaux Ateliers. (espace Business Center)
Optic-Lab
Le but de l’OpticLab est de permettre aux participants, débutants ou microscopistes plus expérimentés, d’apprendre à réaliser des mesures de performance sur des systèmes optiques et surtout de comprendre les principes physiques sous-jacents à travers des travaux pratiques réalisables de manière autonome (sans ou avec très peu d’encadrement).
L’Optic-Lab est en accès libre, en plus des créneaux Ateliers. (salle Ayguade)
Chem-Lab
Le Chem-Lab propose un atelier sur 4 créneaux où les participants pourront fabriquer leur propre sonde fluorescente puis la tester sur des cellules et visualiser le résultat au microscope. Ce chemlab est limité à 6 personnes et vous devez vous inscrire pour les 4 sessions sur le site Atelier http://ateliers-mifobio.fr.
Le Chem-Lab a lieu les 12, 13 et 15 novembre de 16h à 18h, puis le 15 novembre de 21h30 à 23h. (salle Capte et Les Salins)
Technical Focus
Les Technical Focus sont des rendez-vous où des experts issus de l’industrie proposent d’approfondir les connaissances des participants dans leurs domaines de compétences (laser, détecteur…).
Les Technical Focus ont lieu les 11, 12, 13, 15 et 16 novembre, de 13h30 à 14h en libre accès et sans inscription préalable. (salle Porquerolles)
Practical Setup Focus
Dédié à la découverte des nouvelles technologies présentes à Mifobio, les Practical Setup Focus sont un moment d’échanges et de discussions entre les industriels et les participants autour des systèmes apportés pour l’évènement.
Lien vers le book industriel Mifobio 2023 [PDF]
Les Practical Setup Focus auront lieu le vendredi 10 novembre, de 14h à 15h45, en déambulation dans les différentes salles des industriels.
Scanning Party
La Scanning Party est l’occasion de découvrir les scanners de lame de façon originale, puisque les participants sont invités à apporter leurs lames et à les imager sur les 3 scanners de lames présents à Mifobio. Les images ainsi générées pourront être analysées directement lors d’ateliers (notamment les ateliers Qupath). Le flyer de présentation, le formulaire de description des échantillons à remplir ainsi que les descriptifs des 3 systèmes sont à retrouver ici : https://filesender.renater.fr/?s=download&token=6efe0042-72db-43c0-b7ff-ae2529137405
Les lames seront collectées en début de Mifobio les jeudi 9 et vendredi 10 novembre afin que les images soient disponibles au plus tôt.
Planktoscope
Plankton Planet est une initiative internationale basée en France qui vise à rassembler des acteurs académiques et des citoyens pour étudier le plancton marin et évaluer la santé des océans. Les participants pourront découvrir les outils d’imagerie créés et utilisées par ce consortium, accompagnés du Biodiversarium de l’Observatoire de Banyuls et de son équipe de médiation scientifique autour du milieu marin. Le Planktoscope sera accessible pendant toute la durée de Mifobio.